特殊能力は、主に移動中に効果があるもの(移動時の特殊能力)、戦闘中に効果があるもの(戦闘時の特殊能力)、 イベントに関わってくるもの(必要時の特殊能力)などに分けられます。
また、部隊のリーダーにしたときのみ効果があるリーダー特殊能力というものもあります。